魔法少女奈叶 The MOVIE 1st

　　1988年7月，关东地区使用新型炸弹进行爆破，第三次世界大战即刻爆发。31年后，人类从一片废墟中重建都市，东京湾上建立了巨大城市——新东京。世界仿佛要恢复到以前的繁荣。
　　2019年的一个夜晚，新东京郊外的封闭高速公路上，暴走族团体正在公路上飙车。带头的少年，是一名叫做金 田的职业高中学生。
　　突然，街上出现了一位奇怪的矮个子男子，暴走族少年铁雄为躲避车祸连人带车飞出公路。正当金田要拿那位男子问罪之时，军队驾驶直升飞机赶到。将那位矮个男子与铁雄一起收押。
　　铁雄进入了一个陌生的地方，这里似乎在从事超能力的研究。而金田则在盘算如何营救铁雄。二人都不知道，他们的未来，因为神秘力量——阿基拉而已经开始了巨大的变化。

　　东京私立贵大高等学校高一年级的学生弄内洋太追求同学早川然美，正当他准备告白时，却发现然美喜欢的是他的好友——同班同学新舞贵志，于是他陷入了无奈与失落。一个人走在回到家的路上，洋太的情绪十分低落，自己也不知道怎么就走到了一家名叫GOKURAU的出租录影带的商店前。洋太走过一排排录影带架后，在一盒录影带前停了下来：《安慰——天野爱》。借回家的录影带在播放过程中，天野爱居然从画面中走出！爱鼓励洋太要努力追求真爱，并以洋太妹妹的身份住在洋太家中。谁也没有想到，一段感人的恋爱故事就这样开始。

　　1989年，日本。
　　乔纳森·乔斯达与DIO决战后的一百年，DIO复活了。同时，乔瑟夫的孙子，空条承太郎发现自己有幽波纹（替身）能力，DIO的复活影响了没有替身抵抗能力的母亲，陷入病危情况；为了拯救命在旦夕的母亲，承太郎与乔瑟夫出发前往DIO的所在地——埃及。

　　里斯提亚国偏僻乡村领地的下级贵族——奥恩斯坦家住着一对姐弟。
　　姐姐玛丽是一个非常喜欢接受父亲练习剑术的活泼女孩。弟弟席恩是个腼腆的男孩子，他非常喜欢呆在房间里看书。虽然两人性格完全相反，但在温柔的父母的守护下，和睦地生活着。
　　有一天，席恩问父亲“魔法”这个东西在这个世界上是否存在。但是，即使是作为贵族有一定教养的父亲，也不知道“魔法”这个词本身。更何况，席恩所说的“从火、水、风、光等元素各种各样的东西”的现象，在这个世界上是不可能存在的……
　　从那一天开始，席恩就显得很失落。但是，有一天，在和姐姐玛丽一起去的湖里，他目睹了“宛如魔法般”的不可思议现象——
　　“现在放弃还为时过早。如果没有魔法，自己做就好了！”
　　席恩开始研究魔法，一边将周围的人卷入其中一边稳步前进。飞出的火焰，奔跑的闪电——一切都是为了使用前世所憧憬的“魔法”！