在科技发达的未来，网络上流传着一种真假不明、被称为“全息幽灵”的奇怪现象。 初中一年级的天之河宙，启动了父亲留下的“数码暴龙机”开始能看到大家看不见的未知生物“数码宝贝”......
刚晋升上尉的莱因哈特和吉尔菲艾斯少尉，从前线调职回奥丁的军务省。在探访安尼罗杰时得知姐姐的好友和别的贵族发生冲突，当时贵族们流行以旧式火药单发手枪决斗来解决一切纷争。莱因哈特决定为帮助姐姐的好友，出任决斗者。得知此事的培尼明迪侯爵夫人，决定乘此机会将莱因哈特杀死，暗中派出专业杀手。莱因哈特埋首不断苦练火药枪技术，不仅得到吉尔菲艾斯的协助，一名青年军官的教导及示范，使莱因哈特对火药枪的使用技巧增加了不少。这名军官便是日後的帝国元帅鲁兹少校。在决斗场上，暗杀者瞄准了莱因哈特的心脏。然而面对暗杀者的莱因哈特，在此电光石火之际竟然处於劣势，莱因哈特最终中弹……
幼时曾深陷绝望深渊的直枝理树，与4位少年少女相遇了。 在那之后数年，理树作为Little Busters的一员，喧闹地过着快乐的每一天。 这样的时间能够一直持续就好了。理树所期望的只有这样。 某日，恭介突然表示要成立一支棒球队伍， 理树则开始了寻找成员的任务。 在这样的过程中，理树邂逅了新的成员们。 和大家一起参加试胆大会，潜入女生宿舍时被换上女装，一起演人偶剧……。 经历了许多快乐的事情， 同时也在大家的帮助下解决了各自拥有的烦恼。 最后在棒球比赛中，理树确认了和最好的朋友们之间的牵绊。 ——然而，这并不是结束。 和来谷唯湖之间的故事。 理树与铃的故事。 以及，理树和铃终于知晓的“世界的秘密”。 Little Busters真正的物语，自此开始——。
风太郎和五胞胎的高中生活只剩下半年，最后的暑假就要开始了。为了集中精力学习考试，风太郎告诉五胞胎暑假期间不做家庭教师的兼职。因为暂时见不到风太郎而悲伤的五胞胎，突然收到了风太郎打来的电话……。
1989年，日本。 乔纳森·乔斯达与DIO决战后的一百年，DIO复活了。同时，乔瑟夫的孙子，空条承太郎发现自己有幽波纹（替身）能力，DIO的复活影响了没有替身抵抗能力的母亲，陷入病危情况；为了拯救命在旦夕的母亲，承太郎与乔瑟夫出发前往DIO的所在地——埃及。
由于过去的心理阴影而变成家里蹲的高中生·贯井响，私下有着使用歌唱软件制作歌曲，并投稿到视频网站的兴趣。给这样的他寄来“想要见面交谈”的邮件的，是小学五年级的少女们。自幼就如同姐妹一般一起长大的三人所提出的请求，是为了对照顾过自己的人们表达感谢，在她们曾度过的回忆之地成功地举办演唱会……。
信长深爱的妹妹·市，嫁给了浅井长政。 而浅井·朝仓军与织田军的冲突已经不可避免。 只要有一瞬的迷惘就会失去重要事物的大规模野战“姊川之战”，含泪的千鸟于此战觉醒。 名为天下布武的不合常理的征程！ 不得不将自己的妹夫打倒！！ 本格时代剧搞笑动画，姊川·石山篇 突入！！
